A República de Moçambique e a Ordem Soberana de Malta estabeleceram formalmente relações diplomáticas através da assinatura de um Protocolo, em fevereiro de 1997. Ao longo dos anos, a relação tem sido caracterizada por intercâmbios diplomáticos e cooperação humanitária, apesar da ausência de um Acordo de Cooperação formal.

Um dos principais objetivos da Embaixada era atuar como elo de ligação entre a Ordem de Malta França (OMF) e o Governo de Moçambique (Ministério da Saúde). Neste quadro, foi alcançado um marco significativo após a receção do despacho do Ministro dos Negócios Estrangeiros e Cooperação aprovando o registo e autorizando tanto o início da atividade da OMF como a construção de um Centro de Referência da Hanseníase em Anchilo, Nampula.

No entanto, em abril de 2023, a Ordem de Malta França notificou o Ministério da Saúde moçambicano, através de uma Carta Oficial de Desvinculação do centro de projetos a construir na província de Nampula. De acordo com a carta oficial assinada pelo Diretor Internacional, Thierry LION, “o projeto a ser construído no Centro Anchilo, embora validado pelo Ministério da Saúde, encontrou problemas administrativos e instabilidade de segurança na região. Estas razões levam a Ordem de Malta França a suspender indefinidamente as suas atividades em Moçambique e, em particular, a retirar-se do projeto de construção do centro Anchilo”.

De facto, uma freira italiana de 83 anos foi morta num ataque em setembro de 2023 na missão onde vivia, na diocese de Nacala. Os rebeldes atacaram a missão, incendiando todos os edifícios. Irmã Maria, missionária comboniana, morreu durante a emboscada.

Desde então, a Embaixada angariou e entregou donativos em três ocasiões, nomeadamente:
Janeiro de 2025: Doação de leite em pó ao Centro de Reabilitação Nutricional para crianças com desnutrição de 0 a 3 anos em parceria com o Access Bank;
Março de 2023: Na sequência das inundações registadas no Distrito de Boane, a Embaixada da Ordem Militar Soberana de Malta em Moçambique. reuniu, com o apoio da Midas Moçambique e da NBC Representations, mais de 800 produtos de higiene e limpeza para doação às vítimas desta tempestade. Os produtos foram doados em meados de março à Cooperativa de Educação Ambiental Repensar, na cidade de Matola;
Fevereiro de 2023: entrega de bens de primeira necessidade para apoiar as vítimas das cheias de Boane. As mercadorias foram entregues à Cooperativa de Educação Ambiental Repensar. Durante a ocasião, fizemos uma breve visita ao local. Através desta iniciativa, a Embaixada pretendeu contribuir para a minimização de doenças que possam surgir nos locais de acolhimento.